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玩轉(zhuǎn)環(huán)境樣本檢測,專業(yè)方案讓你事半功倍!
來源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時間: 2024-09-05 | 87 次瀏覽 | 分享到:


你相信嗎?
無需潛入深海,無需深入?yún)擦?僅憑一杯水或一抔土
便能開啟生物多樣性探索的奇妙之旅
揭秘如江豚等珍稀生物的蹤跡
這就是環(huán)境DNA技術(shù)的魔力!
從環(huán)境樣本中提取DNA片段,結(jié)合PCR和DNA測序等分子生物學(xué)技術(shù)來定性或定量檢測目標(biāo)生物,可以對土壤、水體、空氣等環(huán)境介質(zhì)中的微生物、生物體等進(jìn)行分析。作為新型的環(huán)境研究技術(shù)手段,廣泛應(yīng)用于生物多樣性研究、環(huán)境監(jiān)測、動物食性分析等多個領(lǐng)域。
環(huán)境樣本的核酸提取難點解析
· 樣本前處理復(fù)雜:
環(huán)境樣本中微生物及其他生物體種類繁多,不同生物體的核酸含量、結(jié)構(gòu)等差異較大,使得前處理過程難以統(tǒng)一。
· 提取得率不穩(wěn)定:
不同微生物或生物體的細(xì)胞結(jié)構(gòu)不同,如G+、G-和真菌在細(xì)胞壁成分和厚度方面具有明顯差異,裂解不充分可能使核酸提取出現(xiàn)偏好性,加上傳統(tǒng)手工操作導(dǎo)致得率不穩(wěn)定。
· 抑制劑多影響下游實驗:
環(huán)境樣本中常含有腐殖質(zhì)、色素等雜質(zhì),干擾核酸提取純化和后續(xù)的檢測分析。
· 操作繁雜,通量低:
傳統(tǒng)的核酸提取方法通常涉及多個步驟,操作繁瑣,通量低。
TIANGEN 環(huán)境樣本解決方案
TIANGEN憑借多年的核酸純化經(jīng)驗,針對環(huán)境樣本提取檢測難題,整合了一套高效的自動化解決方案。該方案能輕松應(yīng)對各類環(huán)境樣本,顯著提升提取效率和產(chǎn)量。提取出的核酸可直接用于PCR、建庫、測序等分子生物學(xué)實驗。

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環(huán)境樣本自動化核酸提取產(chǎn)品

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方案優(yōu)勢

前處理簡單

高通量研磨均質(zhì)儀搭配預(yù)分裝研磨珠及成熟的研磨方案,輕松處理各類環(huán)境樣本。

穩(wěn)定均一

磁珠法全自動化提取,穩(wěn)定性好,實驗結(jié)果可重復(fù)性高,均一性好。

得率高

預(yù)分裝研磨珠配合高效裂解液,可裂解多種復(fù)雜成分,保證微生物多樣性及得率。

純度高

獨特的脫腐殖酸緩沖液可有效去除腐殖酸等抑制物,獲得高純度DNA。

通用性廣

獨特的樣本破碎與裂解體系,適用于各種樣本。

環(huán)境樣本PCR檢測儀器及試劑

TGreat Expert 雙槽梯度PCR儀


· 一臺頂兩臺,節(jié)省空間

· 超大彩色觸控屏幕,程序設(shè)置簡單

· 外觀精美,運行噪音低

· 性能穩(wěn)定,控溫準(zhǔn)確

高保真PCR試劑盒


· 高保真性:為Taq酶的180倍

· 延伸力強:擴增速度5 sec/kb,擴增產(chǎn)物長達(dá)20 kb

· 高靈敏度:基因組模板用量低至1 ng

· 操作簡便:只需加入模板和引物,輕松配體系

環(huán)境樣本檢測文庫構(gòu)建產(chǎn)品

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實驗案例

有效提取多種環(huán)境樣本基因組DNA

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使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613和競品(國際知名品牌A、B)分別提取各類樣本的基因組DNA,TIANGEN提取結(jié)果超過或達(dá)到競品相當(dāng)水平。


16S區(qū)域可有效檢出

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將使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613和競品(國際知名品牌A、B)提取小鼠糞便、竹林土+紅茶粉樣本得到的微生物基因組DNA,用細(xì)菌16S引物(V3-V4)進(jìn)行PCR檢測,電泳結(jié)果顯示,DP613與競品提取的核酸進(jìn)行16S擴增均可有效檢出。

ITS區(qū)域可有效檢出

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將使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613和競品(國際知名品牌A、B)提取池塘淤泥、 竹林土+紅茶粉樣本得到的微生物基因組DNA,擴增ITS區(qū)域(ITS1)進(jìn)行PCR檢測。電泳結(jié)果顯示,DP613與競品提取的核酸進(jìn)行ITS擴增均可有效檢出。

抑制物殘留低,可進(jìn)行后續(xù)實驗

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使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613和競品(國際知名品牌A、B)提取的核酸原液作為PCR的抑制物,加入到qPCR體系中檢測已知濃度的質(zhì)粒,判斷提取產(chǎn)物對PCR實驗的抑制性。結(jié)果表明,DP613提取的核酸,PCR的抑制物與競品B相當(dāng)且優(yōu)于競品A,幾乎不影響定量PCR反應(yīng)。

適用于微生物群落分

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使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613、競品(國際知名品牌A、B)提取微生物群落標(biāo)準(zhǔn)品(標(biāo)準(zhǔn)品-D6300)基 因組DNA,然后進(jìn)行16S測序,分析各菌屬水平檢測的Tags比例。每個試劑盒進(jìn)行兩次平行實驗。結(jié)論:DP613提取 的微生物基因組DNA,8個細(xì)菌微生物均被檢出,與標(biāo)準(zhǔn)品的混合比例類似。

可有效檢出環(huán)境樣本中的生物體

圖片圖片

采集2L池塘水(模擬檢測樣本),分別從上下游的兩個地點取樣,上游樣本編號1和2、下游樣本編號3和4,使用自動化核酸提取純化儀搭配TGuide Smart環(huán)境微生物基因組DNA提取試劑盒(DP613)提取樣本中的DNA,并通過PCR擴增對魚類與底棲類生物進(jìn)行定性檢測,電泳結(jié)果顯示可有效檢出。